La interpretación metafísica bíblica fue el punto central de las enseñanzas de Charles Fillmore. Esto se ve claramente en sus dos libros de interpretación bíblica: Misterios del Génesis y éste, Misterios de Juan.
Charles Fillmore pensaba que el Evangelio de Juan tiene ciertas cualidades espirituales que no se encuentran en los otros evangelios. Fillmore altentaba a quienes deseaban encontrar lo místico a que lo buscaran en el Evangelio de Juan.