Peter Pan on kerran kotoaan karannut poika, joka osaa lentää onnellisten ajatusten ja keijupölyn voimalla ja joka kieltäytyy kasvamasta aikuiseksi. Peterin ystäviä ovat Kultasen perheen lapset Leena ja hänen kaksi nuorempaa veljensä Jukka ja Mikko sekä Helinä-keiju. Peterin ystäviin kuuluvat myös Kadonneet Pojat: Nibs, Tiddler, Tootles, Curly ja kaksoset. Poikien lukumäärä vaihtelee tarinan eri versioissa, mutta alun perin heitä on ilmeisesti ollut nuo mainitut kuusi. Peter on tämän poikajoukon johtajahahmo. Peterin vihollinen on Kapteeni Koukku sekä tämän lähin alainen Mr. Smee. Tarinassa esiintyy joskus myös rohkea intiaanityttö Tiikeri-Lilja, jonka Peter Pan pelasti Kapteeni Koukun kynsistä.
Kertomuksessa esiintyy mielikuvitusmaailma Mikä-Mikä-Maa, joka sijaitsee osoitteessa "toinen tähti oikealla ja suoraan aamuun" ja jossa lapset eivät kasva aikuisiksi, sillä kukaan vanhene päivääkään. Peter houkuttelee Leenan ja tämän veljet mukaansa Mikä-Mikä-Maahan, jossa he sitten Kadonneiden Poikien ja Helinä-keijun kanssa kokevat monia seikkailuja.
Tarinan päällimmäisin aihe on ikuisen nuoruuden ihanuus, lapsuus ja seikkailut, mutta Peter Pan on myös tarina traagisesta rakkaudesta. Peter ja Leena ihastuvat toisiinsa, mutta Peter ei kykene luopumaan ikuisesta lapsuudesta siinä missä Leena haluaa kuitenkin kasvaa tuntevaksi aikuiseksi – tämä on tietysti vain yksi tarinan monista tulkintatavoista. Myös Helinä-keiju on ihastunut Peteriin ja on mustasukkainen Leenasta.
