Dan et Amy ont découvert que tous les objets qu'ils ont volés pour Vesper I permettent de reconstituer une machine de l'Apocalypse sur laquelle travaillait Archimède. Désormais, ils savent que Vesper I a pour dessein de détruire des millions de vies et de prendre le pouvoir. Les deux enfants décident de l'en empêcher... Mais l'ennemi est partout ! Ils apprennent que l'horrible Isabel Kabra est Vesper II, et qu'elle est en route pour Washington DC. Les voici sur une nouvelle piste, direction le musée d'Histoire naturelle...